摘要:目的 克隆中国旱獭Ⅰ型干扰素受体β亚基(mhIFNAR2)的基因,并进行抗体制备及功能鉴定。方法 应用RT-PCR技术,从中国旱獭脾组织中扩增得到序列,克隆至原核表达载体p RSET-B,表达重组蛋白,电泳和Western Blot法鉴定;重组蛋白常规免疫BALB/c小鼠制备其胞外段多克隆抗体,免疫组化、免疫荧光和Western Blot法鉴定;再通过si RNA阻断的方法检测其功能。计量资料多组间比较采用方差分析,进一步两两比较采用LSD-t检验。结果 从mhIFNAR2扩增出149~1 300 bp片段,其同源性在分析的种属中以土拨鼠最高,可达98.05%。成功地构建了表达胞外段mhIFNAR2((50-181aa))蛋白的原核表达质粒,命名为pRSET-B. mhIFNAR2;其表达重组蛋白分子量27 kD,纯化后纯度约为95%,浓度约为160μg/mL。用纯化的重组蛋白常规免疫BALB/c小鼠后,获得1∶1 000的特异性多克隆抗体,用免疫组化及免疫荧光可见细胞膜、细胞质有表达。合成的三条siRNA,其中有一条起始于277位点的siRNA(siRNA277)与空白对照及阴性对照相比,可以沉默目的基因的表达,并能减弱干扰素的信号通路(P值均<0.05)。结论 获得mhIFNAR2的部分序列,成功地制备出抗mhIFNAR2胞外段多克隆抗体,该抗体有较高的效价和特异性,并能用于免疫组化、免疫荧光及Western Blot的检测。用siRNA277可以抑制目的基因的表达,并能阻断干扰素的信号通路。
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α/β干扰素共用Ⅰ型受体,该受体有α、β两个亚单位,分别称为IFNAR1和IFNAR2[1,2,3,4]。中国旱獭是研究HBV感染的重要动物模型[5,6]。本研究对中国旱獭Ⅰ型干扰素受体β亚基(marmata himalayana typeⅠinterferon receptorβsubunit,mhIFNAR2)进行了克隆、表达和抗体制备,并在体外用siRNA鉴定其功能,为研究干扰素抗土拨鼠肝炎病毒的确切机制、土拨鼠肝炎病毒持续感染的原因及提高干扰素的疗效奠定基础。
1、材料与方法
1.1材料
HepG2细胞、DH5α、BHK细胞、脑心肌炎病毒(encephalomyocarditis virus,EMCV)由同济医学院附属协和医院感染科实验室保存;WH12-6细胞由德国埃森大学陆蒙吉教授提供;pSUPER由美国Baylor大学细胞生物学系冯新华教授惠赠;引物和RNAi由上海英俊公司合成;限制性内切酶PstⅠ、EcoRⅠ、BglⅡ和SalⅠ、pMD18T载体、DL2000、T4 DNA连接酶、T4多核苷酸激酶购自Takara公司;Trizol、Lipofectamine2000TM购自Invitrogen公司;质粒抽提试剂盒为北京博大泰克生物基因技术有限公司生产;Taq酶和胶回收试剂盒为Tiangen公司产品;d NTP由上海凌飞公司提供;DMEM由Hy Clone公司提供;M-MLV逆转录酶、RNasin由美国Promega公司提供;小牛血清购自杭州四季青公司;凝胶成像分析系统购自美国UVP公司。根据其他哺乳动物干扰素受体的保守性设计引物,由上海英俊公司合成,其他哺乳动物在GenBank中的序列号分别为:鼠NM_010509,牛NM_174553,羊NM_001009342,人NM_207585(表1)。RT-PCR扩增目的基因mhIFNAR2(50-181aa)。
1.2方法
1.2.1 mhIFNAR2的克隆
根据其他哺乳动物干扰素受体的保守序列设计引物,克隆具体步骤见文献[7]。
1.2.2Ⅰ型干扰素受体β亚基的表达及多克隆抗体的制备
测定重组质粒pRSET-B.mhIFNAR2核酸序列;重组质粒pRSET-B.mhIFNAR2转化高效表达菌Rossetta(DE3)plysS;菌体总蛋白的Western Blot分析:转膜后利用兔抗His-probe(H-15)作为一抗,HRP标记的羊抗兔IgG作为二抗进行Western Blot检测目的蛋白的表达;融合蛋白的大量制备及纯化:取纯化蛋白液20μL,加2×蛋白电泳上样缓冲液20μL于管中,100℃煮沸5 min。SDS-PAGE电泳,考马斯亮蓝染色观察纯化效果;检测蛋白纯度:将目的蛋白表达过程中的各个组分进行SDS-PAGE电泳,结果进行蛋白条带灰度扫描,并用Gelwork1D advanced V4.01软件分析。检测蛋白浓度:通常每次纯化的样本都要行SDS-PAGE检测纯化样本的纯度,高纯度的样本被收集起来,用标准的Bradford法(考马斯亮蓝G-250法)测定蛋白浓度,为下一步免疫动物作准备。以纯化的重组蛋白mhIFNAR2B(50-181aa)为免疫原,每次取120μg溶于1 mL PBS中,再与等体积的氢氧化铝佐剂混合,按40μg/只的抗原剂量,分别免疫3只BALB/c小鼠,颈背部皮下多点注射。第14天和第28天时各加强免疫一次,加强免疫的方法和抗原剂量同上。第35天摘小鼠眼球取血,静置离心后分离血清。
表1干扰素受体β亚基的引物序列
1.2.3多克隆抗体特异性鉴定
外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)来源于中国旱獭,其分离的步骤如下:1 mL抗凝全血加入等体积的PBS混匀;将步骤1中的稀释全血用滴管沿管壁缓慢叠加在另一个装有2 mL的淋巴细胞分离液离心管内,注意保持清楚界面;2 500 r/min,离心20 min,管内液体分三层(从下至上为红色细胞层、分离液层、血浆层)。上层与中间层有一白色云雾状狭窄带,包括淋巴细胞、单核细胞、血小板;抽吸云雾层至灭菌管中,加入5倍体积以上的灭菌PBS(或D-Hank’s),2 000 r/min,离心5 min,弃上清;加入5倍体积以上的灭菌PBS(或D-Hank’s),2 000 r/min,离心5 min,弃上清;加入含10%小牛血清的RPMI1640 500μL重悬细胞,每张APES处理的玻片上滴加100μL,自然风干后用冰丙酮固定30 min行免疫组化及免疫荧光检测。用Western Blot检测其滴度。
1.2.4 mhIFNAR2功能的初步鉴定
1.2.4. 1中国旱獭α干扰素的制备
将生长状态良好的BHK细胞接种到6孔板内;生长24 h后,细胞长满至80%~90%;溶液A:2.5μg质粒+Optim无血清培养基,总体积为100μL;溶液B:5μL Lipofectamine2000+95μL Optim无血清培养基;两者室温放置5 min;混合溶液A和B,轻轻混匀,室温放置25 min;期间用无菌D-hank’s及培养基洗细胞两次,并加入1 600μL无血清培养基;溶液A+溶液B内加入200μL Optim无血清培养基,轻柔混匀后加入培养细胞孔内;37℃孵育5 h;换用完全培养基2.0 mL培养48 h后收获培养上清液,分装后冻存于-70℃,待测干扰素生物学活性。
1.2.4. 2 EMCV感染滴度的测定
将生长在培养瓶内的WH12-6细胞消化后加入Ham’s-12培养基,轻轻吹打分散细胞后转种到96孔板内,100μL/孔;待细胞在96孔板内长成单层后倾去培养液,滴定不同浓度的EMCV到细胞孔内,从原液逐渐至10-10,呈10倍系列稀释,100μL/孔,同时做细胞阴性对照,每个梯度接种4孔细胞,第2天观察细胞生长状况,计数不同稀释度出现细胞病变效应(cytopathic effect,CPE)孔数,然后按Reed-Muench法计算半数组织培养感染剂量(TCID50)。
1.2.4. 3中国旱獭干扰素α效价的确定
将生长在培养瓶中的WH12-6细胞消化后加入Ham’s-12培养基,轻轻吹打分散细胞转种到96孔细胞培养板内;待细胞在96孔板内长成单层后倾去培养液,加入不同4倍系列稀释的BHK细胞转染上清100μL/孔,每个稀释度有4个细胞孔,继续培养24 h,加入0.1 mL EMCV,继续培养24 h,以保护50%细胞不出现CPE的BHK细胞转染上清液最高稀释度作为干扰素效价。
1.2.4. 4 si RNA干扰实验
WH12-6细胞培养于含10%FBS的Ham’s-12培养基中,于5%CO2、饱和湿度及37℃条件下培养。勿使细胞融合度>90%以防止细胞老化。si RNA由广州锐博公司提供合成,序列见表2。另外设计一条阴性对照序列,Blast验证为任何物种的无关序列。
将正常培养于6孔板的WH12-6细胞于转染前改用无抗生素Ham’s-12培养基培养24 h。取2μL Lipofectamine2000加入250μL Opti-MEM培养基,轻轻混匀。室温孵育5 min。取20μmol/L合成siRNA,加入250μL Opti-MEM培养基,siRNA的终浓度分10、20及50 nmol/L三个梯度,轻轻混匀,室温孵育5 min。随后将两者轻轻混合,室温孵育20 min。加入一孔细胞中,用无血清无抗生素Ham’s-12培养基定容至2 mL。于37℃、5%CO2培养箱中培养6 h。换为含血清、抗生素的全培养基,培养24 h后加用中国旱獭干扰素刺激(同前),24 h后加Trizol提取RNA。用Trizol提取培养的WH12-6细胞总RNA,逆转录成c DNA,使用SYBR Green嵌合荧光法进行RT-PCR扩增,反应条件为95℃、60 s预变性,95℃、15 s共40个循环,60℃、20 s延伸。mh IFNAR2、Mx A荧光定量RT-PCR引物序列如下:mh IFNAR2(正义)ACAATCCACCGTGCCAACT,mhIFNAR2(反义)AACAGCATCGCTTTCCCTC;MxA(正义)CAGATTGTCTACTGCCAGGACCAGGT,MxA(反义)AGCCGCTCCTTCAGGAACTTC;β-actin(正义)TGGAATCCTGTGGCATCCATGAAAC,β-actin(反义)TAAAACGCAGCTCAGTAACAGTCCG;通过标准曲线获得直线回归方程,从而得到各个目的基因mRNA的拷贝数,将其除以内参的拷贝数,然后乘以104作为该目的基因的相对值。
1.3统计学方法
采用SPSS 18.0软件进行统计学分析。计量资料以表示,多组间比较采用方差分析,进一步两两比较采用LSD-t检验。P<0.05为差异有统计学意义。
2、结果
2.1 mh IFNAR2的克隆、鉴定及同源性比较
RT-PCR从脾组织中扩增出149~1 300 bp的mh IFNAR2片段,并经测序证实[7]。同源重组构建重组质粒,经PCR、酶切和测序证实,命名为p RSET-B.mh IFNAR2。mh IFNAR2149-1300核苷酸序列与土拨鼠、人、牛、羊及小鼠的同源性分别为98.05%、72.89%、69.17%、69.76%及64.95%(图1)。
2.2重组蛋白的表达
2.2.1重组质粒核苷酸组成示意图
ATG---6×His---Pst ImhIFNAR250-181TGA---B BEcoR I
2.2.2重组蛋白的小量诱导表达
SDS-PAGE电泳可见,pRSET-B.mhIFNAR2重组质粒经IPTG诱导后1~6 h在大肠杆菌中均有表达,且在诱导4 h时获得量最大,而空菌及空载体转化菌诱导4 h在27 kD处仅有较弱条带(图2)。
表2 mhIFNAR2 siRNA模板序列
2.2.3目的蛋白的纯化
诱导后的菌体超速离心后,经SDS-PAGE电泳发现目的蛋白大部分存在于沉淀中,且主要以包涵体的形式存在。经Ni-NTA纯化得到的目的蛋白纯度为95%,浓度约为160μg/mL(图3)。
2.2.4目的蛋白的Western Blot检测
抗His与纯化的重组蛋白反应,可见有特异性条带(图4)。
2.3制备抗体的检测
2.3.1免疫组化检测抗mh IFNAR2多克隆抗体特异性
抗原抗体结合部位可见明显的阳性着色(图5a),mh IFNAR2抗原的分布主要呈胞质型和胞膜型。而应用正常小鼠血清作为一抗则无阳性显色(图5b)。
2.3.2免疫荧光结果
PBMC中mhIFNAR2免疫荧光检测主要分布于细胞质和细胞膜(图6),而阴性对照则无阳性显色。
2.3.3 Western Blot检测
用纯化的重组蛋白免疫BALB/c小鼠后,获得了高效价的特异性多克隆抗体。经用Western Blot检测的效价为1∶1 000。
2.4干扰素效价的测定
以保护50%的细胞不出现CPE的BHK细胞转染上清稀释度作为干扰素的效价,表3为EMCV感染滴度测定结果,本实验所测得的干扰素效价为1∶128。
图1 mhIFNAR2片段核苷酸组成物种同源性比较
图2 SDS-PAGE电泳分析His-mhIFNAR2蛋白的表达
2.5 siRNA干扰效应
起始于840位点的siRNA840对WH12-6细胞mh IFNAR2基因无明显的抑制作用(P>0.05)(图7)。起始于277位点的si RNA277(20 nmol/L)对WH12-6细胞mhIFNAR2、M×A基因有明显抑制作用,差异均具有统计学意义(P值均<0.05)(表4)。
图3 pRSET-B.mhIFNAR2蛋白纯化图
图4纯化的目的蛋白Western Blot检测
图5 mhIFNAR2多克隆抗体的免疫组化结果(DAB,×400)
表3 EMCV感染滴度测定结果
图6 PBMC中mhIFNAR2免疫荧光检测
图7不同浓度的siRNA840对WH12-6细胞mhIFNAR2、M×A基因的抑制作用
表4不同浓度的siRNA277对WH12-6细胞mhIFNAR2、M×A基因的抑制作用
3、讨论
干扰素受体由α、β两个亚基组成,当其与干扰素结合后迅速引起TYK2、JAK1、STAT1、STAT2磷酸化,进而激活转录产生各种抗病毒蛋白。尽管干扰素发现已有50年的历史,但直到1990年才鉴定出干扰素受体由α、β两个亚基组成。其中β亚基有长、短及可溶等三种形式[8,9,10]。随着干扰素与其受体相互作用、信号转导机制及生物应答研究的深入,干扰素受体在介导干扰素抗感染中的天然免疫、获得性免疫以及肿瘤中的作用逐渐引起人们的注意,干扰素受体缺失引起严重的病原体感染[11,12]。但是,干扰素在不同的细胞中会产生相反的生物学效应。比如在大多数细胞中干扰素表现为抑制增殖,促进凋亡,却可延长记忆性T淋巴细胞的存活时间[13,14]。因此,阐明干扰素受体复合物的功能有助于解释这些现象的原因。在乙型肝炎动物模型中阐明干扰素抗病毒的作用机制及HBV的持续性感染具有重要的临床意义。
本研究利用哺乳动物干扰素受体序列的保守区设计引物,成功地从中国旱獭脾组织中克隆出mh IFNAR2149-1300。mhIFNAR2149-1300核苷酸序列与土拨鼠、人、牛、羊及小鼠的同源性分别为98.05%、72.89%、69.17%、69.76%及64.95%。该结果与笔者前期克隆的中国旱獭其他分子相似[15,16,17,18]。
干扰素是具有多种生物功能的细胞因子,其发挥效应的始动环节是与其受体结合,使胞内段发生磷酸化,激活转录从而产生各种抗病毒蛋白。本研究目的是在mh IFNAR2克隆的基础上,在体外用抗体阻断及si RNA干扰的方法进一步证实所克隆基因的正确性,了解mh IFNAR2在干扰素信号通路的作用,为在乙型肝炎动物模型中国旱獭体内实验奠定基础。
前期研究[14]结果显示IFNAR2与干扰素结合的重要位点包括E78、W101、I104以及D105,而既往的一些研究[19,20]也发现干扰素受体胞外段作为免疫原可以产生中和抗体。因此本文选择了mhIFNAR2(50-181aa)胞外段重组蛋白作为抗原制备抗体。
本实验以胞外段mhIFNAR2重组蛋白免疫小鼠,制备了抗mhIFNAR2的多克隆抗体。对所获得的抗血清进行了Western Blot检测,证实制备的多克隆抗体特异性良好,具有免疫学活性,不仅可以识别作为免疫原的融合蛋白,还能有效识别PBMC中的mhIFNAR2蛋白。免疫组化及免疫荧光检测可见mhIFNAR2抗原的分布主要呈胞浆型和胞膜型。并且免疫血清在较高稀释浓度下即可检测到mhIFNAR2蛋白,且无明显的非特异性条带,证实了多克隆抗体的高效性和抗mhIFNAR2的特异性,为进一步研究mhIFNAR2及干扰素在乙型肝炎动物模型中的作用提供了实验基础。
本研究用该抗体进行干扰素受体封闭实验,结果显示无明显作用(具体数据未展示),原因可能有:(1)某些抗体虽然可以与其受体结合,但是不能阻断干扰素的作用,且不同干扰素型别存在差异[21,22];(2)不同细胞系与抗体的结合力也存在差异[17];(3)一些抗体并不能阻止干扰素与其受体结合[22]。此外,本研究制备的是多克隆抗体,一是没有纯化,二是某些多克隆位点可能对干扰素信号通路产生影响。
本研究设计、合成针对中国旱獭mh IFNAR2的si RNA,并在基因水平成功验证了起始于277位点的si RNA能够有效抑制mh IFNAR2的表达,为深入研究mh IFNAR2的功能和机制,尤其是为在乙型肝炎中的研究提供了一个手段。
利益冲突声明:本文不存在任何利益冲突。
作者贡献声明:陶颖、樊和斌负责课题设计,资料分析,撰写论文;李智、刘艺、桂文甲参与收集数据,修改论文;杨东亮、王宝菊对课题进行指导;樊和斌负责拟定写作思路,指导撰写文章并最后定稿。
基金资助:国家自然科学基金(3021170);国家重大基础研究项目(973)(2005CB522900)~~;
文章来源:陶颖,杨东亮,王宝菊等.中国旱獭Ⅰ型干扰素受体β亚基克隆、表达及功能初步鉴定[J].临床肝胆病杂志,2024,40(02):278-283.
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