摘要:目的 探究藜芦胺(VTM)对人胶质母细胞瘤(GBM)细胞U251增殖的影响及其潜在机制。方法 借助网络药理学方法,筛选VTM干预GBM的铁死亡相关交集靶点,并进行基因本体、京都基因和基因组百科全书富集分析。以U251细胞为对象,采用CCK-8法、细胞克隆形成实验、细胞形态变化观察、2′,7′-二氯荧光素二乙酸酯(DCFH-DA)荧光探针法、FerroOrange荧光探针法、Western blot实验对VTM抑制U251细胞增殖的作用及可能机制进行验证。结果 共筛选出VTM干预GBM的铁死亡相关交集靶点462个,富集于氧化应激、细胞凋亡等生物学过程,胞质囊泡、线粒体膜等细胞成分,影响二价铁离子(Fe2+)结合、DNA转录过程等分子功能,以及铁死亡、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路等。40、60、80、100、120、140μmol/L的VTM均可显著降低细胞存活率(P<0.01);40、80、120μmol/L的VTM可使细胞萎缩、细胞核破碎,可显著抑制其克隆形成,显著提高其活性氧(ROS)、Fe2+水平,并可不同程度地上调核转录因子红系2相关因子2(Nrf2)、血红素加氧酶1(HO-1)蛋白的表达,下调谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)蛋白的表达(P<0.05或P<0.01)。结论 VTM可抑制U251细胞的增殖,促进细胞内ROS和Fe2+的蓄积,从而诱导铁死亡,上述作用可能与调控Nrf2/HO-1/GPX4信号通路有关。
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胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)又称恶性胶质瘤,是中枢神经系统常见的原发性恶性肿瘤,约占所有中枢神经系统肿瘤的33%,具有恶性程度高、致死率高、复发率高的特点[1,2]。目前,GBM的临床治疗以手术治疗联合放疗及替莫唑胺化疗的传统疗法为主,但该疗法不良反应大,患者易出现化疗耐药且预后较差[2],因此迫切需要寻找高效、低毒的辅助药物或替代疗法。
近年来,天然产物在肿瘤研究领域扮演了重要角色。藜芦胺(veratramine,VTM)为甾体生物碱类成分,是百合科植物藜芦的有效成分之一。体外研究表明,VTM可通过诱导肿瘤细胞自噬、凋亡来抑制其增殖[3,4]。铁死亡是一种由铁依赖性脂质活性氧(reactive oxygen species,ROS)异常累积所引发的非凋亡性程序性死亡方式,与恶性肿瘤、神经退行性疾病等多种疾病密切相关,并在肿瘤细胞生长、耐药等方面发挥着重要作用[5]。本课题组前期预实验证实,VTM可抑制GBM细胞的增殖,但这种作用是否与铁死亡过程有关以及其具体作用机制尚不清楚。为此,本研究拟通过网络药理学方法预测VTM作用于GBM的潜在靶点、基因功能及信号通路;同时,拟借助体外细胞实验,初步验证该成分通过诱导铁死亡来抑制GBM细胞活性的可能机制,以期为GBM治疗和新药研究提供新思路。
1、材料
1.1 主要仪器
本研究所用主要仪器包括3111型CO2细胞培养箱、EVOSF1型荧光显微镜(美国Thermo Fisher Scientific公司),CKX41型光学倒置显微镜(日本Olympus公司),STNERGYH1型酶标仪(美国Agilent公司),C6型流式细胞仪(美国BD公司),165-8001型蛋白电泳仪、ChemⅠDoc型超高灵敏度化学发光成像系统(美国Bio-Rad公司)等。
1.2 主要药品与试剂
VTM原料药(批号HY-N0837,纯度99.61%)、CCK-8试剂盒(批号HY-K0301)均购自美国Med Chem Express公司;DMEM高糖培养基(批号2327860)、胎牛血清(批号10091148)均购自美国Gibco公司;4%多聚甲醛固定液(批号P0099)、结晶紫染色液(批号C0121)、胰酶消化液(批号C0201)、Western blot细胞裂解液(批号P0031)、BCA蛋白浓度测定试剂盒增强型(批号P0009)、2′,7′-二氯荧光素二乙酸酯(DCFH-DA)荧光探针(批号S0033)均购自上海碧云天生物技术有限公司;FerroOrange荧光探针(批号F374)购自东仁化学科技(上海)有限公司;兔源谷胱甘肽过氧化物酶4(glutathione peroxi‐dase 4,GPX4)单克隆抗体(批号T56959)购自艾比玛特医药科技(上海)有限公司;兔源血红素加氧酶1(heme oxygenase 1,HO-1)单克隆抗体(批号ab214039)、兔源核转录因子红系2相关因子2(nuclear factor-erythroid 2-related factor 2,Nrf2)单克隆抗体(批号ab137550)均购自英国Abcam公司;兔源甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)单克隆抗体(批号2118S)购自美国CST公司;辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔Ig G二抗(批号ZB-2306)购自北京中杉金桥生物技术有限公司。
1.3 细胞
人GBM细胞U251购自美国ATCC菌种保藏中心。
2、方法与结果
2.1 网络药理学分析
2.1.1 VTM作用靶点预测
以“VTM”为关键词,在Pharm Mapper数据库、Swiss Target Prediction数据库、Target Net数据库、Batman-TCM数据库中检索其可能的作用靶点,合并、去重后,共筛选得到VTM预测靶点16 397个。
2.1.2 GBM和铁死亡相关靶点获取
以“glioblastoma”“glioma”为关键词,在CTD数据库、Drug Bank数据库、Gene Cards数据库、OMIM数据库、Pharm GKB数据库、TTD数据库中进行检索,并在Pub Med数据库中进行补充检索,合并、去重后,共得到GBM疾病相关靶点5 865个。通过Ferr Db数据库获取铁死亡相关靶点(ferroptosis-related genes,FRGs)1 043个。
2.1.3 VTM干预靶点的获取及富集分析
将上述获取到的药物预测靶点、疾病相关靶点、FRGs进行交叉,利用R语言的“Venn”包进行分析,获取VTM干预GBM的铁死亡相关交集靶点462个。利用Uni Prot数据库对上述交集靶点进行标准化校正,运用R语言的“Cluster Profiler”包进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析以及京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析,以P<0.05为条件进行筛选并对富集基因数与总基因数的比值(简称“富集基因占比”)进行排序(由大到小),再运用“ggplot2”包对富集分析结果进行可视化展示,得到VTM干预GBM的主要功能及可能途径。
GO功能富集结果(图1)显示,VTM干预GBM的生物学过程(biological process,BP)主要涉及氧化应激、细胞凋亡、对金属离子的响应、自噬调节等;细胞成分(cel‐lular components,CC)主要涉及胞质囊泡、线粒体膜、细胞膜和核糖体等部位;分子功能(molecular function,MF)主要包括影响二价铁离子(Fe2+)结合、DNA转录过程和多个氧化还原酶活性等。
KEGG富集结果(图2)显示,VTM干预GBM主要涉及铁死亡、磷脂酰肌醇3激酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,又称Akt)、自噬、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of ra‐pamycin,m TOR)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、细胞凋亡等信号通路。
GO和KEGG富集分析结果显示,VTM干预GBM涉及多条信号通路,其中氧化应激和铁死亡信号通路均排名靠前。基于此,本研究选择与氧化应激、铁死亡均相关的信号通路Nrf2/HO-1/GPX4[6,7,8,9]作为后续研究的重点。
图1 VTM干预GBM的GO功能富集结果气泡图(富集基因占比排名前15位)
2.2 体外细胞实验
2.2.1 细胞培养
将U251细胞培养于含10%胎牛血清的DMEM高糖培养基中,于37℃、5%CO2条件下培养,隔天换液传代,取对数生长期细胞进行后续实验。
2.2.2 细胞存活率检测
采用CCK-8法进行检测。取对数生长期的U251细胞,按5 000个/孔接种于96孔板中,按“2.2.1”项下方法常规培养过夜。将细胞分为对照组(VTM 0μmol/L)和VTM不同浓度组(40、60、80、100、120、140μmol/L,浓度参考相关文献[4]设置),并设置不加药物、不加细胞的空白组,每组设3个复孔。培养24 h后,每孔加入CCK-8工作液10μL,孵育1 h。使用酶标仪于450 nm波长处检测各孔的光密度(OD)值并按下式计算细胞存活率:细胞存活率=(OD实验组-OD空白组)/(OD对照组-OD空白组)×100%。采用Graph Pad Prism 8.3.0软件对数据进行统计分析,实验数据以x±s表示,多组间比较采用单因素方差分析,进一步两两比较采用LSD-t检验,检验水准α=0.05(统计方法下同)。结果(图3)显示,与对照组比较,VTM各浓度组的细胞存活率均显著降低(P<0.01),且有一定的浓度依赖趋势。
图2 VTM干预GBM的KEGG富集结果柱状图(富集基因占比排名前10位)
图3 不同浓度VTM对U251细胞存活率的影响
2.2.3 细胞克隆形成能力检测
采用细胞克隆形成实验进行检测。取对数生长期的U251细胞,按500个/孔接种于6孔板中,常规培养过夜。将细胞分为对照组和VTM不同浓度组(40、80、120μmol/L,浓度参考“2.2.2”项下实验结果设置),每组设3个复孔。培养24 h后,弃去培养基,加入新鲜培养基,培养14 d;弃去培养基,细胞用磷酸盐缓冲液(PBS)洗涤后,置于4%多聚甲醛固定液中固定20 min,随后用0.1%结晶紫染色液染色30 min,用PBS洗涤后自然干燥,拍照并观察细胞克隆形成情况,按下式计算细胞克隆形成率:细胞克隆形成率=集落形成数/每孔细胞总数×100%(细胞数>50为1个集落)。结果(图4)显示,80、120μmol/L的VTM均可显著抑制U251细胞的克隆形成(P<0.05或P<0.01)。
图4 VTM对U251细胞克隆形成能力的影响
2.2.4 细胞形态变化观察
取对数生长期的U251细胞,按1.5×105个/孔接种于6孔板中,常规培养过夜。细胞按“2.2.3”项下方法进行分组、处理。培养24 h后,使用倒置显微镜观察各组细胞的形态变化。结果(图5)显示,相较于对照组细胞,VTM各浓度组细胞的排列明显更为松散,可见细胞明显萎缩,并伴有大量漂浮的死亡细胞,且VTM作用浓度越大,其对细胞形态的影响越明显。
2.2.5 细胞内ROS水平检测
采用DCFH-DA荧光探针法进行检测。取对数生长期的U251细胞,按1.5×105个/孔接种于6孔板中,常规培养过夜。细胞按“2.2.3”项下方法进行分组、处理。培养24 h后,弃去培养液,细胞用PBS洗涤3次后,加入DCFH-DA荧光探针(10μmol/L),常规孵育30 min;用PBS洗涤3次后,置于荧光显微镜下观察各孔的荧光(绿色)变化情况并使用Image J软件计算其荧光相对强度,用以表示细胞内ROS水平。结果(图6)显示,与对照组比较,VTM各浓度组细胞内的绿色荧光均有所增强,其ROS水平均显著升高(P<0.05或P<0.01),有一定的浓度依赖趋势。
2.2.6 细胞内Fe2+水平检测
采用Ferro Orange荧光探针法进行检测。取对数生长期的U251细胞,按2×105个/孔接种于6孔板中,常规培养过夜。细胞按“2.2.3”项下方法进行分组、处理。培养24 h后,弃去培养液,细胞用无血清培养基洗涤3次后,加入Ferro Orange荧光探针(1μmol/L),常规孵育30min后,置于荧光显微镜下观察各孔的荧光(红色)变化情况并使用Image J软件计算其相对荧光强度,用以表示细胞内Fe2+水平。结果(图7)显示,与对照组比较,VTM各浓度组细胞内的红色荧光均有所增强,其Fe2+水平均显著升高(P<0.01),有一定的浓度依赖趋势。
2.2.7 细胞内铁死亡通路Nrf2/HO-1/GPX4相关蛋白表达的检测
采用Western blot法进行检测。取对数生长期的U251细胞,按2×106个/皿接种于100 mm培养皿中,常规培养过夜。细胞按“2.2.3”项下方法进行分组、处理。培养24 h后,裂解提取全细胞蛋白并以BCA法测定蛋白浓度。取变性后的蛋白样品适量,经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳分离后转移至聚偏二氟乙烯膜上,用5%脱脂牛奶室温封闭1 h;以TBST缓冲液洗膜后,加入Nrf2、HO-1、GPX4、GAPDH一抗(稀释比例均为1∶1 000),于4℃下孵育过夜;以TBST缓冲液洗膜后,加入相应二抗(稀释比例为1∶5 000),于37℃下孵育1 h;以TBST缓冲液洗膜后,用ECL显影液显色,于化学发光成像系统下曝光成像。使用Image J软件进行分析,以目的蛋白与内参蛋白(GAPDH)的灰度值比值作为各目的蛋白的表达水平。结果(图8)显示,与对照组比较,VTM 80、120μmol/L组细胞内GPX4蛋白的表达水平均显著降低(P<0.01),VTM 120μmol/L组细胞内Nrf2蛋白和VTM各浓度组细胞内HO-1蛋白的表达水平均显著升高(P<0.05或P<0.01),上述作用有一定的浓度依赖趋势。
图5 VTM对U251细胞形态影响的显微图
图6 VTM对U251细胞内ROS水平的影响
Ⅰ:对照组的ROS表达荧光图;Ⅱ:VTM 40μmol/L组的ROS表达荧光图;Ⅲ:VTM 80μmo/L组的ROS表达荧光图;Ⅳ:VTM 120μmol/L组的ROS表达荧光图;Ⅴ:各组细胞的ROS水平柱形图;a:与对照组比较,P<0.05;b:与对照组比较,P<0.01。
图7 VTM对U251细胞内Fe2+水平的影响
图8 VTM对U251细胞内铁死亡通路相关蛋白表达的影响
3、讨论
GBM是恶性程度高、侵袭性强、致死率高的中枢神经系统恶性肿瘤,严重影响患者的生存质量[1]。考虑到现有疗法的局限性,挖掘靶向抑制GBM细胞增殖的药物对改善患者预后具有重要的临床意义。
本研究在前期预实验基础上,首先借助网络药理学手段,筛选得到了VTM干预GBM的铁死亡相关交集靶点462个;随后的GO功能富集结果显示,VTM干预GBM的CC包括胞质囊泡、线粒体膜等,MF涉及Fe2+结合、DNA转录过程等,BP以氧化应激、细胞凋亡等为主;进一步的KEGG富集结果显示,VTM干预GBM的作用靶点分布于铁死亡、PI3K/Akt等信号通路。上述结果提示,VTM对GBM的干预作用可能是通过激活氧化应激、铁死亡等信号通路来实现的。基于此推测,本研究结合交集靶点分析及铁死亡相关研究结果[6,7,8,9],选取Nrf2/HO-1/GPX4信号通路进行初步验证。
本研究通过CCK-8法、细胞克隆形成实验、细胞形态变化观察发现,不同浓度的VTM可不同程度地抑制U251细胞的增殖和克隆形成,并可造成细胞萎缩、细胞核破碎等,上述作用有一定的浓度依赖趋势,初步确定了VTM对U251细胞活性的抑制作用。研究指出,铁死亡不仅是GBM细胞程序性死亡过程中的主要类型[7],而且可影响脑胶质瘤患者的药物治疗效果及预后,还可影响神经退行性疾病的病理过程[8,9],提示铁死亡可作为神经肿瘤、神经系统疾病治疗和新药研发的关键靶点。作为一种细胞死亡方式,铁死亡与其他死亡方式的区别在于,铁死亡涉及了铁代谢和脂质ROS蓄积的过程,Fe2+可通过芬顿反应来诱导细胞内ROS的蓄积,从而诱导铁死亡的发生[5]。为了验证VTM能否通过铁死亡来抑制GBM细胞活性,本研究采用DCFH-DA和Ferro Orange荧光探针法分别检测了VTM作用后细胞内ROS和Fe2+水平,结果显示,二者荧光强度均明显增强,提示VTM可诱导细胞内ROS和Fe2+的蓄积,且有浓度依赖趋势。
近期多项研究表明,Nrf2/HO-1/GPX4信号通路与铁死亡通路调控密切相关。其中,Nrf2、HO-1是抗氧化系统的主要调控因子,同时也在涉及铁死亡的铁代谢、脂质代谢等过程中发挥了重要作用[10,11,12,13]。研究指出,作为调节氧化还原稳态的重要蛋白,Nrf2的异常表达可导致脂质氧化及铁死亡的发生[14];同时,Nrf2可在上游调节HO-1蛋白的表达,以启动对细胞的保护作用,可通过调控GPX4蛋白的表达,进而影响细胞铁死亡进程[15]。此外,作为细胞抗氧化活性的重要调节因子,Nrf2还具有一定的双重作用:在正常情况下,该蛋白的表达水平较低,被激活后可抑制肿瘤的形成;在病理条件下,Nrf2能促进肿瘤细胞的增殖及转移,减轻化疗药物导致的氧化应激损伤,阻止肿瘤细胞凋亡、自噬并促进耐药,从而影响患者预后[16,17]。有研究发现,Nrf2在高级别胶质瘤细胞中有更高的表达,可作为胶质瘤病理分析的标志物[18]。GPX4是一种启动内源性抗氧化反应元件的转录因子,也是铁死亡的重要调节因子,可保护细胞免受ROS蓄积所致的氧化损伤,维持细胞脂质稳态;当GPX4表达被抑制时,脂质过氧化物将不断蓄积,并进一步诱导铁死亡的发生[10,11,12,13]。与正常神经胶质细胞相比,人GBM细胞(U251和U87)中GPX4蛋白的表达水平更高,且该蛋白对铁死亡诱导剂的敏感性更强[19]。可见,靶向调控GPX4蛋白的表达可能是GBM治疗的有效手段,GPX4蛋白可作为潜在的肿瘤标志物。本研究的Western blot实验结果显示,与对照组比较,VTM 80、120μmol/L组细胞内GPX4蛋白的表达水平均显著降低,VTM 120μmol/L组细胞内Nrf2蛋白和VTM各浓度组细胞内HO-1蛋白的表达水平均显著升高,提示VTM可通过调控Nrf2/HO-1/GPX4信号通路来诱导U251细胞铁死亡。
笔者通过查阅近期研究发现,Nrf2、HO-1蛋白对于靶向铁死亡治疗肿瘤具有关键作用,即抑制Nrf2蛋白的过表达,可增强肿瘤细胞对化疗药物的敏感性,逆转肿瘤细胞的耐药,促进细胞铁死亡的发生[20];同时,HO-1蛋白可通过铁蓄积等途径来促进铁死亡的发生[21,22]。然而,VTM能否通过干预Nrf2、HO-1蛋白的过表达来影响铁死亡的过程尚需后续实验探讨。
综上所述,VTM可抑制人GBM细胞U251的增殖,促进细胞内ROS和Fe2+的蓄积,从而诱导铁死亡,上述作用可能与调控Nrf2/HO-1/GPX4信号通路有关;VTM可作为一种潜在的铁死亡诱导剂。本课题组后续将进一步结合通路抑制剂、小分子RNA干扰等方式并基于本网络药理学提示的自噬、凋亡等其他通路来完善对VTM干预GBM作用机制的探索。
参考文献:
[6]关锡梅,解勇圣,倪伟建,等.Nrf2/HO-1/GPX4对高糖诱导足细胞铁死亡的影响及小檗碱的干预机制研究[J].中国药理学通报,2021,37(3):396-403.
基金资助:重庆市研究生教育“课程思政”示范项目(No.YKCSZ23057);重庆市卫生计生委中医药科技项目(No.ZY201801004);
文章来源:曹梓珍,张琳,傅若秋等.藜芦胺对人胶质母细胞瘤细胞U251增殖的影响及机制[J].中国药房,2023,34(22):2734-2739.
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