摘要:目的:研究miR-655-3p在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)组织及细胞系中的表达及其对细胞系生物学功能的调控作用。方法:通过qRT-PCR的方法检测HNSCC组织及细胞系(FaDu、SCC-9、TU686、TU212)中miR-655-3p的表达水平,并通过一系列细胞生物学实验检测miR-655-3p对细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响,进一步筛选miR-655-3p可能靶基因,探究其作用机制。结果:与癌旁正常组织中表达水平(3.17±0.20)相比,miR-655-3p在HNSCC癌组织中表达降低(2.89±0.17),P<0.05;与对照正常细胞系相比,miR-655-3p在HNSCC细胞系中表达降低,P<0.05。而过表达细胞系中miR-655-3p的表达后,可明显抑制HNSCC细胞系的增殖、迁移及侵袭能力,进一步机制研究表明ZEB1作为miR-655-3p的靶基因受其负向调控,miR-655-3p通过靶向抑制ZEB1的表达进而抑制HNSCC细胞系上皮-间充质转化进程。结论:miR-655-3p在HNSCC癌组织及细胞系中低表达,能够通过靶向调控ZEB1的表达,抑制细胞系恶性表型的进展。
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MicroRNA(miRNA)是一类长约20~24个核苷酸的微小非编码RNA,通过其“种子区”与靶mRNA的3'-UTR(3'-untraslatedregions)或开放阅读框以碱基互补配对的方式结合,从而在转录后水平引起靶mRNA的降解或翻译抑制[1]。而某些核型miRNA成熟后被转运至细胞核内,并在转录水平发挥调控作用。研究发现,miRNA可以在肿瘤代谢、癌细胞凋亡、癌细胞干性维持等诸多方面发挥肿瘤调控作用,包括HNSCC的发生发展[2,3]。如miR-205-5p在HNSCC中表达增高,并通过靶向抑制BRCA1和RAD17的mRNA水平,从而降低DNA损伤修复能力并增加染色体不稳定[4]。既往研究发现,miR-655-3p在视网膜母细胞瘤、食管鳞状细胞癌、非小细胞肺癌等肿瘤中表现出抑癌作用,具有重要临床意义,但目前尚未发现miR-655-3p在HNSCC中的相关研究[5,6,7]。因此,本研究旨在通过系列实验,初步探索miR-655-3p在HNSCC发生发展中的可能作用机制,为深入探究HNSCC的发病机理提供一定的理论依据。
1、资料与方法
1.1一般资料:
本研究纳入手术治疗的HNSCC患者组织样本(均未接受放化疗)25例,其中男性23例,女性2例;年龄42~67岁,中位年龄56岁;Ⅰ~Ⅱ期8例,Ⅲ~Ⅳ期17例;中-高分化18例,低分化7例;13例伴颈部淋巴结转移,12例不伴颈部淋巴结转移。各样本切取癌组织(非坏死瘤体组织)及配对癌旁正常组织(距瘤体边缘0.5cm以上)。样本收集取得患者书面知情同意。本研究取得医院伦理委员会批准。
1.2方法
1.2.1细胞培养及转染:
本研究所采用HNSCC细胞系(FaDu、SCC-9、TU686、TU212)和正常对照细胞系人支气管上皮细胞系(HBE)购自北京北纳创联生物技术研究院,并按细胞系说明书常规培养。细胞系转染(miR-655-3pmimics/NC)按照Lipofectamine2000(Invitrogen,美国)说明书操作步骤完成。
1.2.2总RNA提取及反转录:
按照RNAprep Pure TissueKit和RNAprepPureCell/BacteriaKit(天根,北京)说明书分别提取组织及细胞系总RNA。所提取总RNA质控合格后,按照miRcutePlus miRNA First Strandc DNAKit和Fast King RTKit(WithgDNase)(天根,北京)说明书分别完成miRNA和mRNA反转录。
1.2.3基因相对表达水平检测:
各组织样本及细胞系中miR-655-3p、ZEB1、E-cadherin(CDH1)、N-cadherin(CDH2)、Vimentin相对表达水平检测,分别以U6、GAPDH为内参照,按照QuantOneStepRT-qPCRKit(天根,北京)说明书通过qRT-PCR仪(安捷伦,美国)完成,相对表达量以2-△△ct计算。相关引物(表1)由上海吉玛制药技术有限公司合成。
表1引物序列
1.2.4MTT细胞增殖实验:
按照MTTCellProliferationand Cytotoxicity AssayKit(碧云天,上海)说明书操作步骤,通过酶标仪测定570nm波长附近的吸光度,以检测细胞增殖能力。
1.2.5Transwell实验:
细胞转染24h后,制备细胞悬液,每Transwell(8μm)小室(BD,美国)加入4×104个细胞,常规培养24h后,收集、固定并计数穿透小室基底的细胞数(侵袭实验需提前将小室基底包被基质胶)。
1.2.6双荧光素酶报告基因分析:
通过生物信息学分析,预测miR-655-3p的可能靶基因ZEB1及其可能结合位点,由上海吉玛制药技术有限公司合成报告载体pmirGLO-ZEB1-3'UTRwild-type(Wt)和pmirGLO-ZEB1-3'UTRmutant-type(Mut),将双荧光素酶报告基因质粒、miR-655-3pmimics/NC、Wt和Mut按不同分组通过Lipofectamine2000实现细胞共转染。进一步按照双荧光素酶报告系统Dual-Luciferase Reporter Assay System(Promega,美国)说明书操作步骤,完成各组荧光素酶活性检测。
1.3统计方法:
数据资料通过SPSS19.0软件进行统计分析,组间比较采用t检验,数据以表示,P<0.05为差异显著。
2、结果
2.1在HNSCC组织及细胞系中miR-655-3p呈低表达:
与配对癌旁正常组织中表达水平(3.17±0.20)相比,miR-655-3p在HNSCC癌组织中相对表达水平(2.89±0.17)明显降低(图1A),差异有统计学意义,P=0.012。为进一步了解miR-655-3p在HNSCC中的表达趋势,通过检索NCBI-GEODataSets中HNSCC相关miRNA表达谱数据,发现含有miR-655-3p的数据集有GSE31277(GPL9770)、GSE32115(GPL14577)。分析发现,数据集GSE31277中miR-655-3p在HNSCC组织中表达降低(Foldchange=0.52,P=0.013),而数据集GSE32115中miR-655-3p在HNSCC组织中同样低表达(Foldchange=0.48),但差异不显著(P=0.293)(图1B)。与正常对照细胞系HBE中表达水平(0.99±0.03)相比,miR-655-3p在HNSCC细胞系FaDu(0.79±0.02)、SCC-9(0.51±0.02)、TU686(0.78±0.03)、TU212(0.86±0.03)中表达水平降低,P<0.05,且各细胞系表达水平不同(图1C)。而细胞系SCC-9中miR-655-3p表达水平最低,故用于后续功能实验研究。
图1miR-655-3p在HNSCC中的表达情况
2.2miR-655-3p可抑制细胞系SCC-9的增殖、迁移及侵袭能力:
MTT和Transwell实验发现,通过miR-655-3pmimics过表达细胞系SCC-9中miR-655-3p的表达,可明显抑制细胞系SCC-9的体外增殖、迁移及侵袭能力(图2)。
图2miR-655-3p对HNSCC细胞功能的抑制作用
2.3生物信息学预测miR-655-3p可能的靶基因:
为探讨miR-655-3p可能的抑癌机制,本研究通过TargetScan、miRDB、miRTarBase三个数据库分别预测miR-655-3p可能的靶基因,并通过韦恩图计算获得三个数据库共同靶基因22个,进一步通过在线数据库GE-PIA分析22个靶基因在HNSCC中的表达情况,筛选出在HNSCC中高表达的17个(CNBP、ZEB1、MID1、ADAM10、ELK4、SESN3、SLC35F5、ATAD2、SKI、SPIRE1、CAPRIN2、TMEM64、TGFBR2、CANX、ADM、PTP4A1、KPNA6),低表达的5个(HIPK3、WEE1、MA-GI2、TRPS1、SATB1)。本研究前期实验发现miR-655-3p在HNSCC中低表达,而miRNA可以引起靶mR-NA降解,即靶mRNA与miR-655-3p在HNSCC中表达水平呈负相关。因此,本研究着眼于高表达的靶基因。而miRTarBase数据库提示在共同的靶基因中,ZEB1、ADAM10、MAGI2有Luciferasereporterassay、Westernblot、qRT-PCR实验支持,但MAGI2在HNSCC中低表达,因此ZEB1、ADAM10作为miR-655-3p的靶基因筛选重点。既往研究发现,ZEB1作为上皮-间充质转化的促进剂,可促进肿瘤恶性表型的进展[8]。因此,本研究选择ZEB1作为miR-655-3p的靶基因进行后续研究。通过qRT-PCR证实ZEB1在HNSCC癌组织中表达水平(2.04±0.79)高于配对癌旁正常组织(1.66±0.69),差异有统计学意义,P=0.012(图3A),且ZEB1与miR-655-3p在HNSCC组织中的表达水平呈负相关(R=-0.537,P=0.006)(图3B)。
2.4miR-655-3p靶向调控ZEB1的表达:
为进一步探讨miR-655-3p对ZEB1的靶向调控作用,本研究通过qRT-PCR证实,SCC-9细胞系转染miR-655-3pmimics后,ZEB1表达水平(0.60±0.06)显著低于miR-655-3pNC转染后的表达水平(0.98±0.03),P=0.001(图3C)。为证实miR-655-3p与ZEB1的作用关系,通过TargetScan数据库预测二者的结合位点(图3D),并构建pmirGLO-ZEB1-3'UTRwild-type(Wt)和pmirGLO-ZEB1-3'UTRmutant-type(Mut)表达载体,通过pmirGLO-ZEB1-3'UTRWt/Mut和miR-655-3pmimics/NC共转染。双荧光素酶报告基因实验证实,与对照组相比,pmirGLO-ZEB1-3'UTRWt和miR-655-3pmimics能够显著降低荧光素酶活性(P=0.001)(图3E)。
图3miR-655-3p靶向ZEB1调控上皮-间充质转化
2.5miR-655-3p能够抑制HNSCC细胞的上皮-间充质转化:
考虑miR-655-3p能够靶向调控ZEB1的表达,而ZEB1是上皮-间充质转化的重要促进剂,因此本研究推测miR-655-3p能够抑制上皮-间充质转化进程,而qRT-PCR证实过表达miR-655-3p的表达,能够影响细胞系SCC-9中上皮-间充质转化标志物表达水平的改变(P<0.01)(图3F)。
3、讨论
HNSCC是世界上第六位高发恶性肿瘤,每年大约有650,000新发病例,并呈上升趋势,其5年生存率大约50%[9]。因此,深入探究HNSCC的发病机制,筛选相关肿瘤标志物或靶向治疗的新靶点,对HNSCC的综合治疗具有重要意义。
研究发现miRNA可以通过Notch、WNT/β-Catenin、JAK/STAT或PI3/AKT等多种信号通路,参与肿瘤干细胞的干性维持,如自我更新、分化、上皮-间充质转化等多种恶性表型的生物学调控,从而在包括HNSCC在内的多种肿瘤中发挥促癌或抑癌作用[3]。有报道提出,miR-141通过靶向抑制EGFR的表达,可以抑制HNSCC细胞的增殖、迁移能力,并诱导其凋亡,抑制肿瘤细胞肝转移[10]。另有研究发现,miR-205-5p在HNSCC中通过负向调控BRCA1和RAD17mRNA的表达,抑制DNA损伤修复活性并增加染色体不稳定,从而抑制肿瘤生长[4]。MiRNA在肿瘤,尤其是在HNSCC中的重要作用,促使我们致力于探究HNSCC发生发展中miRNA相关分子机制。
既往研究发现,miR-655能够抑制食管鳞状细胞癌、上皮源性卵巢癌等多种肿瘤细胞的增殖、侵袭能力及上皮-间充质转化进程[11]。MiR-655-3p在多种肿瘤中表达降低并体现出一定程度的抑癌作用,提示其生物学作用具有泛癌性,可能参与了多种肿瘤的发生发展过程。因此,本研究推测miR-655-3p可能在HNSCC中异常表达并参与其某种生物学过程,但目前尚未发现miR-655-3p在HNSCC中的相关研究。本研究初步通过qRT-PCR实验证实miR-655-3p在HNSCC癌组织及细胞系中表达降低,提示miR-655-3p在HNSCC的发生发展中可能具有一定的生物学作用,而细胞功能学实验证实miR-655-3p能够抑制HNSCC细胞的增殖、迁移及侵袭能力,与既往研究中报道miR-655-3p的生物学特性一致。为进一步探讨其作用机制,通过生物信息学分析及双荧光素酶报告基因实验证实,miR-655-3p通过靶向抑制ZEB1mR-NA的表达,抑制HNSCC细胞上皮-间充质转化进程,从而抑制其恶性表型的进展。
综上,本研究初步探讨了miR-655-3p在HNSCC中表达降低,并通过靶向抑制ZEB1的表达,进而抑制HNSCC细胞的增殖、迁移、侵袭能力及上皮-间充质转化进程。本研究进一步丰富了HNSCC中miRNA相关机制研究,为HNSCC的标志物筛选及靶向治疗具有一定的参考意义。
赵雷,肖二彬,梁景卫,刘会清,刘丽娜,田从哲.miR-655-3p通过靶向抑制ZEB1对头颈鳞状细胞癌细胞增殖及侵袭能力的影响[J].河北医学,2020,26(06):921-925.
基金:河北省保定市科技计划项目,(编号:1941ZF092)
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