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呼吸道感染患者病原体核酸检测结果分析

  2020-10-23    1298  上传者:管理员

摘要:目的分析北京大兴地区呼吸道感染患者常见病原体的检测结果。方法收集2019年间首都医科大学大兴教学医院3180名急性呼吸道感染患者的咽拭子样本,采用双扩增技术检测7种常见呼吸道病原体,包括甲型流感病毒、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒、副流感病毒、肺炎支原体和肺炎衣原体。结果呼吸道病原体检出率为20.09%,其中甲型流感病毒检出率最高,其次为肺炎支原体,检出率最低的是肺炎衣原体。各年龄组检出率不同,0~10岁及11~20岁年龄组病原体检出率较高,分别为38.89%和40.11%;各年龄组主要病原体构成有差异,21~40岁检出率最高的是肺炎支原体,其他各年龄组检出率最高的均为甲型流感病毒。各季节检出率不同,差异有统计学意义(χ2=85.67,P<0.05),冬季病原体检出率最高,为26.12%;各季节主要病原体构成有差异,春季检出较多的是甲型流感病毒和乙型流感病毒,冬季检出最多的是甲型流感病毒,夏、秋季检出最多的是肺炎支原体。结论北京市大兴区比较常见的呼吸道感染病原体是甲型流感病毒和肺炎支原体,冬春季为感染高峰期。

  • 关键词:
  • 双扩增技术
  • 呼吸内科
  • 呼吸道感染
  • 呼吸道病原体
  • 感染高峰期
  • 流感病毒
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呼吸道感染是临床常见疾病,可由细菌、真菌、病毒、支原体、衣原体等多种微生物引起,感染力强,临床症状多样[1]。由于病原谱复杂,具有一定的季节性和地域性,加之引起感染的主要病原体—病毒容易变异,因此临床诊断较为困难[2]。本文对北京市大兴区3180例急性呼吸道感染患者的呼吸道病原体检测结果进行分析,为临床早期诊断、治疗及合理用药提供参考依据。


1、资料与方法


1.1一般资料

2019年在大兴教学医院就诊、经临床诊断为急性呼吸道感染的患者3180例,其中男性1660例,女性1520例,平均年龄48岁。

1.2样本采集与检测

采集所有病例的咽拭子样本立即送检。使用7项呼吸道病原体核酸检测试剂盒(武汉中帜生物科技股份有限公司),检测甲型流感病毒(FluA)(包括H3N2及H1N1)、乙型流感病毒(FluB)、呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(AdV)、副流感病毒(PIV)、肺炎支原体(MP)、肺炎衣原体(Cpn)。严格按照试剂盒说明书操作。

1.3统计学方法

采用SPSS19.0软件对数据进行统计分析,计数资料用率(%)表示,组间计数资料的比较采用卡方检验,P<0.05为差异有统计学意义。


2、结果


2.1呼吸道病原体的检出情况

采集3180例患者的3180份咽拭子样本中,7种呼吸道病原体的总阳性率为20.09%(639/3180),其中单一病原体感染占98.12%(627/639),复合感染占1.88%(12/639)。单一感染主要以FluA为主,检出率为9.56%(304/3180),其次为MP,检出率为5.38%(171/3180),Cpn检出率最低(图1)。共检出复合感染12例,常见的为FluA合并其他病原体,FluA+MP2例,FluA+RSV2例,FluA+PIV1例,FluA+FluB2例,FluA+AdV2例,MP+PIV2例,MP+RSV1例。

图1单一感染中7种病原体的检出率

2.2不同性别患者的呼吸道病原体检出情况

男性患者的检出率为18.67%(310/1660),女性为21.64%(329/1520)。男女患者感染的主要病原体相近(表1)。

表1不同性别患者呼吸道病原体检出情况[n(%)]

2.3不同年龄患者的呼吸道病原体检出情况

将所有患者按年龄分组,10岁以下及11~20岁患者的呼吸道病原体检出率较高,分别为38.89%(147/378)和40.11%(75/187);41~80岁患者的检出率较低。21~40岁检出率最高的是MP,其他各年龄段检出率最高的均为FluA(表2)。

表2不同年龄患者呼吸道病原体检出情况[n(%)]

2.4不同季节呼吸道病原体的分布情况

每月呼吸道病原体检出率见图2。其中1月、12月检出率较高,分别为31.82%(147/462)和25.26%(196/776),7月最低,为4.47%(8/179)。按季节分为:春季(3-5月)检出率18.49%(120/649)、夏季(6-8月)7.60%(38/500)、秋季(9-11月)17.29%(97/561)和冬季(12-2月)26.12%(384/1470)。不同季节检出率差异有统计学意义(χ2=85.67,P<0.05)。各季节主要病原体构成有差异,春季检出较多的是FluA和FluB,冬季检出最多的是FluA,夏、秋季检出最多的是MP。

图22019年各月呼吸道病原体检出率


3、讨论


呼吸道感染在世界范围内的发病率及病死率高居第2位,仅次于缺血性心脏病[3],呼吸道病原体的检测方法包括传统的分离培养法、抗体检测、抗原检测和核酸检测法[4,5,6],传统方法已逐渐被核酸检测技术替代[7]。本研究采用的双扩增法是将T7RNA恒温扩增技术和生物素信号放大技术相结合,收集咽拭子样本中的脱落细胞用于核酸检测,主要用于多重呼吸道病原体的定性分析。

本研究分析了2019年呼吸道感染患者的7种呼吸道病原体检出情况,总检出率为20.09%,国内外文献报道称呼吸道感染常见病原体间的复合感染率一般为0.60%~27.00%[8],本研究中复合感染率为0.38%,低于上述报道,可能与检测病原体种类较少有关。本研究使用的病原体检测试剂盒能检测7种病原体,包括5种病毒和2种非典型病原体,不能检测细菌、真菌、其他病毒及非典型病原体。

从病原体的种类看,FluA检出率最高,其次为MP和FluB。我国国家流感中心发布的流感周报显示,2019年全国范围内流感病毒检出的主要亚型为甲型流感中的H3N2,2018年主要亚型为甲型流感中的H1N1。本研究检测的甲型流感病毒涵盖H3N2和H1N1亚型。

本研究中20岁以下患者病原体检出率较高,表明婴幼儿、儿童及青少年比成年人更易感,与其免疫功能不完善有关。21~40岁青壮年以MP感染为主,其他年龄段对FluA普遍易感。冬季病原体检出率较高,而夏季阳性率最低。与病原体较易在寒冷而干燥的环境中存活有关,并且冬季室内空气流通较差,人群呼吸道黏膜防御能力下降,导致冬季感染率增高。冬、春季为流感流行高峰,应及时接种疫苗并注意防护。


参考文献:

[4]曹清,唐铭钰,杜白露.儿童呼吸道病原检测应用进展及相关研究[J].中华实用儿科临床杂志,2019,34(10):721-725.

[5]郭永盛,邹映雪.儿童呼吸道感染病原体及其PCR检测方法的评价[J].天津医药,2017(9):115-118.

[6]贾雪洋,任红宇,聂旭冬,等.下呼吸道感染病原体检测方法研究进展[J].中国人兽共患病学报,2019,35(3):87-94.

[7]瞿介明,刘海霞.病原体分子诊断技术在下呼吸道感染诊断中的应用及其价值[J].中华结核和呼吸杂志,2019,42(7):486-489.


武迪,祁晓莉,盛伟利,张立英,杜睿.呼吸道感染患者病原体核酸检测结果分析[J].中国国境卫生检疫杂志,2020,43(05):343-345.

基金:大兴区人民医院科研课题(4202002310).

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