摘要:目的膀胱癌(BC)的诊断通常采用侵入式膀胱镜检查,微小RNA(miRNA)在BC中表达失调,可以作为初级诊断和监测的非侵入性尿标记物。本研究旨在探讨尿液miRNA作为BC标记物的诊断价值。方法收集2017-12-01-2018-05-31在宁夏医科大学总医院泌尿外科就诊的48例膀胱癌、23例尿路感染及同期22名健康体检者的尿液,分为对照组、感染组、T1期肿瘤组、T2+T3期肿瘤组。采用Realtime PCR技术,筛选尿液样本miRNA标志物;对筛选的miRNA以Ct值比作为计量方式,绘制ROC曲线分析其诊断价值。结果Realtime PCR结果显示,对照组miR-126、miR-182和miR-146a的Ct值分别为30.08±0.49、32.07±1.17和28.13±0.88,感染组分别为28.37±0.51、30.93±0.40和26.72±0.78,T1期肿瘤组分别为27.62±0.78、29.06±0.43和25.62±0.86,T2+T3期肿瘤组分别为26.04±0.74、25.61±0.64和22.7±0.75,差异均有统计学意义,P<0.05;miR-152表达稳定,组间差异均无统计学意义,P>0.05。ROC曲线分析发现,以miR-182与miR-152的Ct比值作为诊断标准,其诊断价值最高,AUC值为0.8875,特异性80.00%,灵敏性83.33%。结论本研究建立的尿液miRNA比值模型,对于BC诊断有较高参考价值。
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膀胱癌(BC)是世界上最常见的癌症之一,生存率低且远处转移频繁[1]。BC诊断需要侵入式的膀胱镜检查和活组织检查,通常伴有不良反应[2]。尿液细胞学作为无创性的标记技术也在广泛使用,但是容易漏检低等级的膀胱癌。因此迫切需要开发用于BC初始检测和监测的新型诊断方法[3]。液体活检是一种方便、快速、无创的检测方式,体液样本中DNA和RNA可作为诊断、预后和监测恶性肿瘤的潜在标志物[4]。根据肿瘤的组织类型和排出体液的方式,非血液液体活检在肿瘤诊断具有新的潜力。针对BC而言,尿液样本相比于血液样本更容易获得,并含有大量有意义的特殊分子标记物,如RNA和代谢产物等,且本身的物质复杂水平远远低于血液样本,这大大降低了RNA处理和分析过程的干扰[5]。基于尿液样本核酸肿瘤标记物的检测,已经在BC诊断中有所报道,例如尿液中的细胞和无细胞DNA可通过尿液甲基化分析用于BC诊断[6]。尿液NMP22、CK20和存活素mRNA可作为标志物用于BC的诊断[7]。但是尿液中存在DNA酶和RNA酶,会降低mRNA的稳定性和含量,因此mRNA作为标记物的使用还会面临很多问题。与长链的mRNA相比,非编码miRNA仅有19~22nt的长度,不易降解,具有很好的稳定性。尿液miRNA作为肿瘤标记物具有较高诊断价值,本研究旨在制备BC尿液miRNA检测模型,并进行临床诊断价值评价。
1、对象与方法
1.1病例选择及一般资料
选取2017-12-01-2018-05-31就诊于宁夏医科大学总医院泌尿外科膀胱癌患者作为研究对象。纳入标准:均具有典型临床表现的住院患者;经由膀胱镜检及病理确诊,均进行手术切除,病理分期符合2002年WHO的TNM临床分期标准;尿路感染患者纳入标准为具有典型临床表现,尿沉渣白细胞>30或显微镜镜检白细胞>8。排除标准:住院时间<24h的患者;放弃治疗的患者;存在自身免疫性疾病、免疫缺陷性疾病以及肿瘤患者;近期接受免疫抑制治疗者;一周内得过感染性疾病或者服用过抗生素的患者(尿路感染患者除外);具有慢性疾病的患者或长期服药的患者。
根据纳入和排除标准共选取48例膀胱癌患者和23例尿路感染患者,另选取同期在宁夏医科大学总医院健康体检者22名作为对照。本实验经宁夏医科大学伦理委员会审批(伦理编号:2019-157),所有标本来源的患者和健康对照者均签署了知情同意书。
1.2实验分组
特异性miRNA的筛选收集48例标本,共分为4组,对照组:健康体检患者12名,男5名,女7名,中位年龄58岁;感染组:尿路感染患者12例,男2例,女10例,中位年龄64岁;T1期肿瘤组:膀胱癌T1期患者12例,男7例,女5例,中位年龄69岁;T2+T3期肿瘤组:膀胱癌T2a期2例,T2b期5例,T3a期4例,T3b期1例,男8例,女4例,中位年龄73岁。
再次收集45例样本纳入后期验证实验,共分为4组,其中对照组:10名健康体检者,男6名,女4名,中位年龄61岁;感染组:11例尿路感染患者,男3例,女8例,中位年龄64岁;T1期肿瘤组:11例膀胱癌T1期患者,男7例,女4例,中位年龄68岁;T2+T3期肿瘤组:13例膀胱癌T2+T3期患者,T2a期5例,T2b期3例,T3a期4例,T3b期1例;男7例,女6例,中位年龄70岁。
1.3主要试剂及仪器
HEPES溶液(1mol/L,pH7.5)购自Thermo Fisher Scientific公司;异硫氰酸胍购自Sigma公司;miRcute miRNA提取分离试剂盒(DP501)、miRcute增强型miRNA cDNA第一链合成试剂盒(kr211)、miRcute增强型miRNA荧光定量检测试剂盒(FP411)、miRNA检测引物均购自于北京天根生物有限公司;荧光定量PCR仪(Roche,LightCycler480Ⅱ);低温高速冷冻离心机(Eppendorf,5810R);生物安全柜(ESCO,AC2-2S1);-80℃低温冰箱(Panaso-nic,MDF-U54V)。
1.4样本收集
样本的收集采用15mL无菌无酶离心管,收集新鲜晨尿中段尿7mL,其中加入3.54g异硫氰酸胍,待溶解完全后加入HEPES盐溶液调节尿液样本的pH值至7,最终定容至总体积10mL,此时HEPES浓度为0.5mol/L,异硫氰酸胍浓度为3mol/L,样本统一-80℃保存。
1.5miRNA的提取
miRNA的提取采用miRcute miRNA提取分离试剂盒进行。将收集的尿液样本解冻,全部转移至50mL无菌无酶离心管,加入5mL氯仿,剧烈震荡,室温静止后溶液形成分层。将上层水相全部转移至试剂盒中二氧化硅过滤柱,4℃12000r/min离心1min,r=5.5cm,按照试剂盒说明书进行洗涤,最终溶解于20μL无菌无酶水中。
1.6miRNA的定量PCR检测
采用miRcute增强型miRNA cDNA第一链合成试剂盒,采用3’加polyA尾巴的方法进行miRNA第一链cDNA的反转录。加入8μLRNA提取液,2×miRNARTReactionBuffer10μL,miRNARTEnzymeMix2μL,总体积为20μL。反应条件为42℃60min,95℃3min。合成的cDNA反应液放置于-20℃保存。采用miRcute增强型miRNA荧光定量检测试剂盒(SYBR Green)进行miRNAs的表达检测。2×miRcutePlusmiRNAPreMix10μL,Reverse Primer(试剂盒自带通用引物,10μmol/L)0.4μL,Forward Primer(购买的检测引物及U6检测引物,10μmol/L)0.4μL,miRNA第一链cDNA2μL,ddH2O补足至20μL。荧光定量PCR上机反应条件为95℃15min;94℃20s,63℃30s,72℃34s,5个循环;94℃20s,60℃34s,40个循环,每个孔设5次重复,取平均值进行计算,每对引物设置阴性质控,采用ddH2O作为阴性模板对照。U6上游检测引物为5′-CTCGCTTCGGCAGCACA-3′,下游为通用引物5′-AACGCTTCACGAATTTGCGT-3′。采用LightCycler4801.5版软件进行Ct值分析。
1.7特异性miRNA的筛选
根据Amuran等[8]对膀胱癌患者尿液中各种miR-NA的生物标志物特性的报道,筛选了hsa-miR-125b、hsa-miR-126、hsa-miR-152、hsa-miR-182、hsa-miR-199a、hsa-miR-204、hsa-miR-143、hsa-miR-133a、hsa-miR-146a和hsa-miR-124,合计10个miRNA对尿液miRNA含量进行分析。
1.8实验分组和计算方式
每个分组中,以U6Ct值最小的,即U6含量丰度最高的样本定义为100%表达,其余样本U6的相对表达含量为2-(Ct组内其他样本)/2-(CtU6丰度最高样本100%)。根据U6的含量进行标准化每个样本,即取等量U6的cDNA,上样量仍为2μL,在组间进行相对定量的表达分析,miRNAs的相对含量=2-ΔΔCt=2-[实验组(Ct目标miRNA-CtU6)-对照组(Ct目标miRNA-CtU6)]。
1.9统计学方法
数据统计及图形绘制采用Grapdpadprism7.0软件,首先进行正态分布检验,如符合采用one-wayANOVA方法分析组间差异,两两比较采用Dunnett-t检验,miRNA检测Ct的比值(CtTargetA/CtTargetB)作为诊断指标,进行ROC曲线分析,采用双侧检验,检验水准α=0.05。
2、结果
2.1不同分组miRNAs的表达差异分析
表1示,miR-126、miR-182和miR-146a在48个标本中均能检测到相应的Ct值,且Ct值均小于阴性质控Ct值,阴性质控CtmiR-126为36.21±0.57,CtmiR-182为37.44±0.68,CtmiR-146为37.26±1.06,且方差分析显示组间差异有统计学意义,可以作为候选miRNA标志物进行验证。
表1miR-126和miR-182及miR-146a在各个组中的平均Ct值及统计分析
2.2尿液miRNA内参的选择
所有样本U6的Ct值均可检测,但是组间差异较大,对照组为31.57±0.63,感染组为33.64±0.77,T1期肿瘤组为30.67±1.01,T2+T3期肿瘤组为29.53±0.86,并且其中12.5%(6/48)的标本Ct值位于阴性质控(38.16±0.94)附近,因此不适用于做内参。而经过U6等量化样本的cDNA上机后发现miR-152在4个组中的Ct值较为稳定,对照组为30.42±0.85,感染组为30.64±0.93,T1期肿瘤组为30.26±0.47,T2+T3期肿瘤组为29.91±0.62,无Ct值接近阴性质控(38.23±0.91)的现象,在本实验中作为内参成分。
2.3miRNA比值作为标记物的分析
再次选取45例样本进行Ct比值分析,结果如图1所示,CtmiR-126/CtmiR-152组间差异有统计学意义(F=3.396,P<0.05),相比于对照组(0.98±0.15),感染组(0.89±0.18)、T1期肿瘤组(0.89±0.25)、T2+T3期肿瘤组(0.91±0.24)比值均降低,t值分别为3.608、3.017和2.286,均P<0.05;CtmiR-182/CtmiR-152组间差异有统计学意义(F=8.139,P<0.01),相比于对照组(1.09±0.25)、感染组(0.99±0.12)、T1期肿瘤组(0.96±0.22)、T2+T3期肿瘤组(0.94±0.24)比值均降低,t值分别为3.672、3.705和4.090,均P<0.05;CtmiR-146a/CtmiR-152组间差异有统计学意义(F=4.617,P<0.01),相比于对照组(0.98±0.21)、感染组(0.90±0.22)、T1期肿瘤组(0.84±0.28)、T2+T3期肿瘤组(0.82±0.14)比值均降低,t值分别为2.685、3.934和2.925,均P<0.05。
2.4miRNA比值的诊断价值分析
图2示,将T1期肿瘤组和T2+T3期肿瘤组进行合并,以对照组进行ROC曲线分析,CtmiR-126/CtmiR-152的AUC值为0.7917,特异性70.00%,灵敏性83.33%;CtmiR-182/CtmiR-152的AUC值最高为0.8875,特异性80.00%,灵敏性83.33%;CtmiR-146a/CtmiR-152的AUC值为0.8625,特异性90.00%,灵敏性79.17%。如果将对照组和感染组合并,进行ROC曲线分析,CtmiR-126/CtmiR-152的AUC值为0.6151,特异性61.90%,灵敏性62.50%;CtmiR-182/CtmiR-152AUC值仍然最高为0.7837,特异性71.43%,灵敏性70.83%;CtmiR-146a/CtmiR-152的AUC值为0.7421,特异性66.67%,灵敏性66.67%。
图1各组miRNACt比值
图2miRNACt比值的ROC曲线
3、讨论
尿液中的核酸分子作为无创BC标记物的有效性已经得到了证实,早在2007年就有学者以尿液中人类端粒酶逆转录酶(hTERT)mRNA作为标记物,进行BC早期的无创诊断研究[9]。Xie等[10]后续建立了以荧光定量PCR进行检测BC脱落细胞的hTERTmRNA表达模式,证实了hTERTmRNA可作为BC早期诊断和预后判断的指标。March-Villalba等[11]针对63例有膀胱肿瘤史及疑似患者和28例BC患者尿液标本的hTERTmRNA表达进行了检测,判断其诊断价值,结果发现hTERTmRNA作为尿液标本的肿瘤标志物,灵敏度为76%,远远高于尿道脱落细胞学和NMP22。然而,Weikert等[12]应用实时逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术对163例BC患者和237例正常人hTERTmRNA的表达水平进行分析,尿液标本的灵敏度只有55.2%,仍然大于脱落细胞的37.5%。这些灵敏度不同的原因在于每个膀胱癌尿液标本中mR-NA的丰度无法保证。尿液标本中具有高灵敏度和特异性的BC相关miRNA生物标志物已经得到共识[13]。miRNA与mRNA不同,尽管方法学一致,都是无创的,简易的荧光定量PCR的检测方式,但是在患者来源的体液标本中miRNA的生物学结构(19-22nt)决定了其作为生物标记物小分子的优势,因为其具有更强的稳定性,更高的基因丰度和更容易达到PCR检测的要求[14]。
在BC组织或者细胞发生转录状态的改变时,往往带来miRNA分子标志物的变化,部分变化的miR-NA分子标志物会在尿液中得到体现,然而在尿液中miRNA的纯度和丰度必须达到一定的量才能进行PCR检测,而且要排除尿液样本的异质性,即每份样本中介质含量各不相同,这影响了miRNA提取,因此每个样本的miRNAs含量差异较大,想要达到应用于临床的标准必须确保实验的重复性和可靠性。本研究采用晨尿7mL,以加入异硫氰酸胍制备裂解液的形式统一保存,经过miRNA富集提取,以U6的含量均一化样本间miRNA本底水平,优化PCR条件,筛选到miR-152可作为内源性参照进行分析,这与Hanke等[15]在尿液检测miRNA的相关实验内参选择一致。上机检测发现miR-126、miR-182和miR-146a在BC全尿中含量水平较高,组间具有差异性,证明这三个miRNA可用于BC的无创检测。
陆阳等[16]对尿液(初步离心除去沉淀)中miR-143、miR-133a的相对表达量在BC诊断中的价值进行分析发现,尿液miRNA143相对表达量诊断BC的AUC为0.827,敏感性为72.70%,特异性为80.80%,尿液miRNA133a相对表达量诊断BC的AUC为0.846,敏感性为75.00%,特异性为85.40%,其或许可作为辅助诊断BC的生物标志物。然而此研究采用的尿液miRNA143和miRNA133a呈低表达,本研究针对高表达miRNA的诊断价值进行探索,因为高表达的miRNA其基因丰度相对较高,易于建立稳定的方法。阎家骏等[17]收集尿沉渣测定BC患者miR-145/miR-142比值,结果显示AUC值为0.755。因为尿液中提取的RNA是综合性质的,有游离的循环RNA,还必须考虑到尿液中相关细胞的RNA,不仅含有肿瘤细胞,还含有凋亡细胞坏死细胞以及非恶性脱落的尿路上皮细胞和白细胞,这些介质带来的影响不能完全认为和肿瘤密切相关。对尿液中的miRNA用于检测BC的研究进行荟萃分析表明,尿沉渣中多种miRNA的BC检测灵敏度最高(86.6%),随机尿中获得的多个miRNA组合检测的特异性最高(85.3%),单独miRNA与多个miRNA组合之间存在显着差异,而用于测试的样本(尿液,上清液,沉淀物)之间没有差异[18]。本研究采用7mL中段晨尿,抽提总RNA,探讨了CtmiR-126/CtmiR-152、CtmiR-182/CtmiR-152、CtmiR-146a/CtmiR-152的比值作为临床标记物应用于BC的诊断的价值评估,结果发现CtmiR-182/CtmiR-152的AUC值最高为0.8875,特异性80.00%,灵敏性83.33%,CtmiR-146a/CtmiR-152的AUC值为0.8625,CtmiR-126/CtmiR-152的AUC值为0.7917;但是如果合并了尿路感染的患者,CtmiR-182/CtmiR-152AUC值则下降到了0.7837,CtmiR-146a/CtmiR-152下降到了0.7421,CtmiR-126/CtmiR-152最低仅有0.6151。miR-126并在人内皮细胞(ECs)和浆细胞样树突状细胞(pDCs)中高度表达,在稳定状态下预处理宿主对病原体感染的反应能力,参与血管生成、癌症以及先天免疫应答[19]。miR-146a参与控制免疫系统和肿瘤发生中起双重作用[20]。因此感染患者的加入不可避免的降低了CtmiR-146a/CtmiR-152和CtmiR-126/CtmiR-152诊断的特异性和灵敏性。
总之,在泌尿系统疾病中,尿液作为最佳的非侵入性来源已被确定为液体活检的一种类型,很可能很快将成为常规临床实践[21]。本研究CtmiR-182/CtmiR-152比值的诊断价值评价已经接近于一些公认的诊断水平,如NMP22的BC检测,灵敏度34.6%~100.0%,特异性60.0%~95.0%[22]。相信随着医院采样系统和尿液处理的全自动化,以及稳定的RNA提取手段,以miRNA为技术的检测手段,可以应用到膀胱癌的常规检测中。
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基金:宁夏医科大学总医院校级课题(XY2017163);宁夏青年科技人才托举工程项目(2017)
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