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新型冠状病毒不同变异株感染者关键流行病学指标及临床分析

2024-04-22 5 上传者：管理员

摘要：目的分析新型冠状病毒(简称新冠病毒)不同变异株感染者流行病学主要指标和临床表现差异,为新冠病毒感染疫情的防控提供参考依据。方法收集2020—2022年安徽省新冠病毒感染者的人口学、流行病学、临床表现及实验室检测等资料,使用SPSS 21.0对不同变异株感染者的流行病学和临床特征进行统计分析。结果共纳入2 416例新冠病毒感染者,其中原始株感染990例、B.1.1.317进化分支感染22例、Delta感染12例、Omicron感染1 392例。新冠病毒不同变异株感染者病例分类、临床分型和Ct值差异均有统计学意义(P<0.001),发热是不同变异株感染首发症状中的主要临床特征。不同变异株感染的潜伏期分别为:原始株9.0(5.0,11.0)d,B.1.1.317变异株8.0(4.0,12.0)d,Delta变异株3.5(3.0,9.0)d,Omicron变异株3.0(1.8,5.6)d,差异具有统计学意义(H=42.448,P<0.001)。原始株感染者的中位代间距为6.0 d,Omicron感染者为3.0 d。结论 Omicron变异株传染性强,更易引起隐匿传播。

关键词：
临床症状
代间距
变异株
新型冠状病毒
潜伏期
续发率
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新型冠状病毒感染(coronavirusdisease2019,COVID-19)自发现以来,截至2023年9月21日,全球累计报告COVID-19确诊病例7.7亿例,死亡人数超过695万[1]。新型冠状病毒(简称新冠病毒)变异频繁,世界卫生组织根据病毒的传染性、致病性和免疫逃逸能力定义了“关切变异株”(variantsof concern,VOC)[2]。新冠病毒通过变异产生了传播力和毒力增强的VOC,如Alpha (B.1.1.7)、Beta(B.1.351)、Gamma(P.1)、Delta(B.1.617.2)及O-micron(B.1.1.529)变异株[3],其中Delta变异株最早在印度被发现,2021年5月被正式命名,2021年6月成为全球大流行的主要变异株[4]。Omicron变异株于2021年11月首次在南非被发现,并迅速成为全球优势毒株[5]。尽管不同新冠病毒变异株引起的症状可能相似[6],但某些变异株与COVID-19临床严重程度或传染性增强有关[7,8]。

2020年1月至2022年5月,安徽省先后发生由新冠病毒原始株、B.1.1.317进化分支、Delta变异株、Omicron变异株引起的疫情。本次研究对上述几种新冠病毒及其变异株引起的COVID-19病例进行分析,了解新冠病毒不同变异株的流行病学特征、传播力、致病力及其感染者的临床特征,为疫情防控提供理论依据。

1、资料与方法

1.1 资料来源

收集2020年1月1日至2022年5月31日安徽省COVID-19病例的性别、年龄、职业、流行病学史、疫苗接种史、首发症状等临床症状信息。COVID-19病例基本信息来源于中国疾病预防控制信息系统传染病监测系统;临床资料和流行病学资料来源于安徽省各级疾病预防控制中心的流行病学调查报告。

1.2 新冠病毒不同变异株感染者来源

(1)原始株感染者:来源于2020年1—2月安徽省16个地市,共990例;(2) B.1.1.317感染者:来源于2021年5月安徽省六安市,共22例;(3)Delta感染者:来源于2020年12月至2022年2月安徽省入境人员集中隔离点,共12例;(4) Omicron感染者:来源于2022年3—5月安徽省铜陵市、芜湖市、阜阳市、六安市、滁州市和淮南市,共1392例。

1.3 指标定义

确诊病例和无症状感染者确诊病例的临床诊断、分型和无症状感染者的定义标准参照该病例报告时国家发布的最新版诊疗方案,并根据临床症状的严重程度,将确诊病例分为轻型、普通型、重型及危重型。

致病力病原体侵入宿主后引起临床疾病的能力。

基本再生数(basicreproductionnumber,R0)在易感人群中输入1例病例在其传染期内预期能产生的新病例数。

有效再生数(effectivereproductionnumber,Rt)在人群并非完全易感或在采取干预措施的情况下,1例病例在其传染期内预期能产生的新病例数。

1.4 实验室检测

采集研究对象的鼻咽/口咽拭子,采用实时荧光定量PCR检测新冠病毒核酸开放读码框1ab(openreadingframe1ab,ORF1ab)和核壳蛋白N,检测工作由省、市级疾病预防控制中心承担。

1.5 统计学分析

采用Office2016进行数据录入和处理,计数资料采用[n(%)]描述,正态分布的计量资料采用(±s)描述,非正态分布资料采用M(P25,P75)描述,SPSS21.0进行统计分析,采用独立样本t检验、非参数检验、χ2检验或Fisher确切概率法比较不同变异株感染者的流行病学及临床特征差异。检验水准α=0.05。

2、结果

2.1 基本情况

共纳入2416例COVID-19,其中新冠病毒原始株感染者990例、B.1.1.317感染者22例、Delta感染者12例、Omicron感染者1392例。原始株感染者中位年龄为45.7(33.8,54.4)岁,18岁以下占4.7%;Omicron感染者中位年龄为36.0(16.1,52.5)岁,18岁以下占30.6%。职业分布中,原始株感染者以农民(占32.4%)和商业服务(占24.6%)为主;B.1.1.317感染者以商业服务为主(占86.4%),Delta感染者以工人(占41.7%)和学生(占33.3%)为主;Omicron感染者以农民(占29.0%)和学生(占27.4%)为主。原始株感染者的地区分布以皖南为主(占52.3%);而Omicron感染者中皖北所占比例较高(占53.9%)。Omicron感染者的发现方式主要为隔离检测和封管控区筛查,共占83.5%。接种疫苗占比以Omicron感染者最高(占93.4%),原始株感染者均未接种新冠病毒疫苗。见表1。

2.2 致病力及临床首发症状分析

990例原始株感染者均为确诊病例,临床分型多为普通型和重型/危重型,共占89.5%;1392例Omicron感染以无症状为主(占97.5%),确诊病例多为轻型(占77.1%)。新冠病毒不同变异株感染者的临床分型差异有统计学意义(χ2=137.007,P<0.001),B.1.1.317、Delta和Omicron感染者均无重型/危重型。70.5%的Omicron感染者Ct值≥25,新冠病毒不同变异株感染者间Ct值分布差异有统计学意义(χ2=17.534,P<0.001)。见表2。

表1安徽省2 416例新冠病毒不同变异株感染者的基本情况[n(%)]

表2安徽省2 416例新冠病毒不同变异株感染者的致病力和Ct值分析[n(%)]

在新冠病毒原始株、B.1.1.317和Omicron确诊病例中,发热为首发症状中的主要临床特征。原始株确诊病例的首发症状主要为发热,占65.8%,其次为咳嗽(占31.2%)和乏力(占12.3%),胃肠道症状占4.2%;B.1.1.317确诊病例的首发症状以发热为主,占64.3%,其次为喉痒,占14.3%;Omicron确诊病例的首发症状以发热为主,占54.3%,其次为咳嗽(占17.1%)、咽痛(占14.3%)和鼻塞/流涕(占11.4%)。见表3。

2.3 关键流行病学指标分析

新冠病毒原始株、B.1.1.317、Delta和Omicron变异株感染者的潜伏期分别为9.0 (5.0,11.0)、8.0 (4.0,12.0)、3.5(3.0,9.0)和3.0(1.8,5.6) d,差异有统计学意义(H=42.448,P<0.001)。Omicron感染者中位代间距为3.0d,原始株感染者为6.0d。原始株感染者的续发率为4.7%,Omicron感染者的续发率为6.1%。Omicron感染者的R0和Rt分别为5.2d和10.0d。见表4。

表3 安徽省1035例新冠病毒不同变异株感染者临床症状分析[n(%)]

表4安徽省新冠病毒不同变异株关键流行病学指标分析

2.4 暴露史及聚集性疫情特征分析

22例B.1.1.317感染者和1075例Omicron感染者的暴露史中,B.1.1.317感染者主要为同事间聚集感染,占68.2%;Omicron感染者主要由同事/同学(占41.4%)和亲属(占32.2%)感染,接触频次主要为“经常”(占66.3%),暴露方式主要为“共同居住生活”占34.5%,其次为“共同工作/学习”占24.6%,暴露地点主要为家中(占34.8%)和工作场所(占24.7%),聚集性疫情以家庭(占35.2%)、学校(占22.5%)和工厂/工地/矿区(占20.6%)为主。

3、讨论

新冠病毒通过密切接触可实现人际传播和无症状传播[9,10],新发传染病的流行病学和临床特征对制定和实施有效的控制措施极为重要,有助于政府、公共卫生工作者和临床医生开展疾病防控、临床实践。本次研究结果显示,新冠病毒不同变异株感染者的潜伏期和代间距等关键流行病学指标有所不同,中位数潜伏期以Omicron变异株最短(3.0d),其次是Delta变异株(3.5d);Omicron感染者中位代间距为3.0d,原始株感染者为6.0d,Delta感染者为3.8d[11],提示Omicron变异株具有更强的传染性,这与河南省、云南省等研究结果一致[12,13],但新冠病毒原始株的潜伏期长于广州市报道的潜伏期[14]。Omicron变异株相对于Delta变异株更易导致社区传播[15],本研究中93.4%的Omicron感染者均接种过新冠病毒疫苗,提示Omicron变异株的免疫逃逸能力较强。因此,需根据不同变异株的潜伏期、代间距、免疫逃逸等流行病学特征,不断优化防控措施。

COVID-19病例临床上以发热、乏力、干咳、鼻塞、流涕、咽痛为主要表现,严重者可快速进展为急性呼吸窘迫综合征、脓毒症休克以及难以纠正的代谢性酸中毒和凝血功能障碍[16]。本次研究结果显示,新冠病毒不同变异株感染者的首发症状在临床上以发热为主,其中原始株胃肠道反应和肌肉酸痛症状偏多,Omicron感染者则以上呼吸道症状为主,这与郭倩等[17]研究结果一致。接种过新冠疫苗的患者临床症状轻且不典型,易造成新冠病毒社区隐匿性传播[18]。

研究显示,新冠病毒原始株感染者地区分布以皖南地区为主(占52.3%),而Omicron感染者多分布于皖北地区(占53.9%)。2022年安徽省多地陆续暴发新冠病毒感染聚集性疫情,鉴于皖北地区人口密度较大,且农村地区居民居住环境、卫生条件、生活习惯、居民防控及就诊意识相对较差[19],导致感染者以皖北地区居多。

本次研究具有一定局限性。2021年安徽省仅发生一起小规模本地聚集性疫情,尚未报告本地Delta感染者,故本次研究的B.1.1.317和Delta感染者的样本量有限,疫情规模的限制可能在一定程度上影响新冠病毒真实的传播特征。

我国于2023年1月8日对新冠病毒感染实施“乙类乙管”[20],新冠病毒感染疫情防控工作进入了新的阶段。新冠病毒不断变异,持续强化新冠病毒变异株动态监测、追踪变异变迁态势至关重要,疾控机构应不断强化监测预警,了解不同变异株的流行病学和临床特征,动态开展疫情风险评估,做好新冠病毒感染疫情的防控工作。

参考文献:

[11]周燕.广州市一起新型冠状病毒Delta变异株暴发疫情的传播特征和防控效果评估研究[D].广州:南方医科大学,2022.

[12]潘静静,王莹莹,王文华,等.一起由奥密克戎变异株BA. 2. 2引起的河南省新冠肺炎本土疫情流行病学特征分析[J].中国公共卫生,2022,38(8):975-979.

[13]邱玉冰,贾曼红,陈金瓯,等.云南省边境地区由新冠病毒原型株和奥密克戎变异株引起的两起新冠肺炎疫情流行特征对比分析[J].中国公共卫生,2022,38(9):1175-1180.

[14]马钰,马蒙蒙,罗业飞,等.广州市新型冠状病毒肺炎密切接触者感染危险因素分析[J].中国公共卫生,2020,36(4):507-511.

[17]郭倩,黄明月,龚磊,等.新型冠状病毒肺炎最新研究进展[J].安徽预防医学杂志,2022,28(3):234-238+254.

[18]李亚飞,范威,王文华,等.一起由新冠病毒奥密克戎变异株引起的学校聚集性疫情[J].中国公共卫生,2022,38(5):614-618.

[19]乔旭界,陈素凤,邱永强,等.新冠肺炎疫情期间农村地区的防疫措施及启示[J].江苏卫生事业管理,2021,32(5):685-688+692.

[20]中华人民共和国中央人民政府.“乙类乙管”正式实施,国务院联防联控机制要求确保疫情防控转段平稳有序[EB/OL].(2023-01-09)[2023-03-21].

基金资助:2022年安徽省新冠病毒科研应急攻关项目(2022e07020071);